下気道マイクロバイオームにおける薬剤耐性遺伝子（ARG）を網羅的に調べた気管支鏡研究です。驚くべきことに、特発性肺線維症（IPF）患者の83％、サルコイドーシス患者の65％にARGが検出され、健常者より有意に高頻度でした。特にテトラサイクリンやマクロライド、βラクタム系への耐性が目立ち、過去3ヶ月以内の抗菌薬使用がARG量を増加させていました。我々呼吸器内科医は、慢性呼吸器疾患の管理においてマクロライド少量長期療法や増悪時の広域抗菌薬投与を行う機会が多いですが、下気道の耐性菌リスクを常に念頭に置き、より厳格なAntimicrobial Stewardship（抗菌薬適正使用）を実践すべきと再認識させられる重要なデータです。

Antimicrobial resistance genes and antibiotic use in chronic lung disease: a bronchoscopy study of the lower airways microbiome
慢性呼吸器疾患における薬剤耐性遺伝子と抗菌薬使用：下気道マイクロバイオームの気管支鏡研究
Kringeland GD, Tangedal S, Julian D, Paytuví-Gallart A, Sanseverino W, Bertelsen RJ, Husebø GR, Knudsen KS, Lehmann S, Nielsen R, Eagan TML.
BMJ Open Respir Res. 2026, 13(1), e003864.

背景：
呼吸器マイクロバイオームにおける薬剤耐性遺伝子（ARG）の特徴は十分に解明されていません。本横断研究では、過去の抗菌薬使用からの期間で調整を行った上で、健常対照者と慢性呼吸器疾患患者におけるARGの存在を比較しました。

研究デザイン：
100名の対照者、93名の慢性閉塞性肺疾患（COPD）患者、13名の喘息患者、34名のサルコイドーシス患者、12名の特発性肺線維症（IPF）患者、および11名の分類不能型間質性肺疾患（uILD）患者から気管支肺胞洗浄（BAL）液を採取しました。参加者は検体採取前14日間は抗菌薬を使用していませんでした。ショットガン・メタゲノムシーケンスをIllumina NovaSeqを用いて実施し、ARGの特定にはNational Database of Antibiotic-Resistant Organismsを使用しました。サンプルのリードは100万リードあたりのカウント数（CPM）に正規化されました。

結果：
全体として、対照者の38％が少なくとも1つのARGを有していたのに対し、COPD、喘息、サルコイドーシス、IPFの患者ではそれぞれ51％、39％、65％、83％でした（p=0.01）。テトラサイクリンに対するARG（33％）が最も一般的なクラスであり、次いでβラクタム系およびマクロライド系の耐性（ともに26％）でした。性別、年齢、体組成、喫煙、および抗菌薬使用を調整したロジスティック回帰分析において、対照者と比較して下気道にARGを有するオッズ比（95％信頼区間）は、COPDで1.30（0.70〜2.41）、喘息で1.00（0.29〜3.52）、サルコイドーシスで3.52（1.40〜8.83）、IPFで6.40（1.25〜32.73）、uILDで3.27（0.76〜14.16）でした。CPMで示したARG数の平均値（標準偏差）は、気管支鏡検査前の3ヶ月以内に抗菌薬を使用していた35名で403.8（537.7）であったのに対し、使用していなかった228名では197.6（355.9）でした（p=0.02）。

結論：
下気道マイクロバイオームにおけるARGの存在は、健常対照者よりもサルコイドーシスおよびIPFの患者で有意に高頻度でした。また、CPMに基づくARG数は、最近の抗菌薬使用と有意に関連していました。